购房协议拆迁是一种常见的房屋买卖方式，双方在买卖合同中约定，当政府需要将该房屋拆除时，卖方必须配合拆迁并按照约定进行赔偿。但是，是否有效还要看具体情况。
首先，根据《合同法》的规定，双方约定的内容是合法有效的，因此购房协议拆迁是有法律效力的。如果卖方违背协议拒绝拆迁，买方可以依据协议向法院起诉要求执行协议。
其次，政府在拆迁过程中也会参考购房协议，但是不一定完全按照协议执行。因为政府有自己的拆迁规划，可能会根据实际情况进行调整和处理。因此，在购房协议中，双方应该对政府政策的调整和变化进行充分考虑，并作出相应的约定。
最后，如果卖方在协议约定过程中提供虚假信息或隐瞒重要事实，政府有权根据实际情况进行拆迁和赔偿，而购房协议也可能被判定无效。
总之，购房协议拆迁是一种有效的房屋交易方式，但双方必须明确约定，同时也需要对政府政策的变化保持敏感，以免出现纠纷。
