首先，公司应该立即启动内部调查程序，查明员工的行为和时间节点等相关情况。如果确实发现员工挪用公款的事实，首先要立即停止员工的工作，同时将其暂时解聘，等待公司进一步做出决定。
其次，公司应该与员工进行沟通，了解其行为的原因。如果是因为个人问题或其他不可抗力因素，公司可以酌情考虑给予暂时宽限的处理方式，如协商分期偿还等，但必须强调对行为的非法性以及违反公司规定的严重性。
最后，公司应该加强内部审计和管理，规范公司的财务操作流程，防止此类事件再次发生。在员工离职后，建议公司尽快承担起追讨公款的责任，同时更正账目，保证公司的财务状况和信誉不受影响。
总之，公司的应对方式应该是果断而严谨的。对于违规行为，应该采取相应的制度性和法律性措施，同时通过加强内部管理和审计，预防类似事件的发生。
