根据我所了解到的法律规定和相关政策，农村宅基地加二层并不是完全合法的。
首先，宅基地的利用应该遵循“三权分置”原则，即宅基地归农民所有，但土地使用权、收益权、转让权等权利应该明确划分给相应的主体。在这种情况下，如果农民想要在宅基地上增添一层建筑，就必须获取相应的建筑许可证，并且需要付出一定的费用。但是由于当前不同地区的政策不同，有些地方规定只能盖一层，有些地方则有一定限制，而在有些地方则是允许增加二层的，这需要具体情况而定。
其次，农村宅基地增加二层可能会违反有关建筑规范和安全规定。二层建筑相比一层建筑来说，结构更为复杂，所需要的建筑材料、技术和经费等方面的要求也更高。如果随意加盖，可能会导致建筑结构不稳，存在安全隐患。如果出现任何安全事故，将会对建筑所有人和周围居民造成极大的财产和人身伤害。
因此，对于农村宅基地加二层是否合法，需要根据当地相关规定和政策来判断。在实际操作中，建议先咨询相关部门，明确政策规定，并且根据自身能力进行规划和施工。同时在增加二层之前，需要找到有资质的专业建筑设计和施工团队进行检查和验收，以确保加建的安全和合法性。
