根据我所掌握的信息，南京协议离婚需要前往当地的民政局进行办理。首先，夫妻双方需要到当地民政局领取离婚申请表，填写完整后缴交相关证明材料。在离婚过程中，需要提供夫妻双方身份证、结婚证、户口簿等相关证件。此外，如果夫妻双方共同拥有的财产需要分割，还需要提供财产证明材料。申请提交后，民政局会安排两周左右的公告期，这期间内如果有异议，当事人可以提出。如果没有异议，两周后民政局将核发离婚证书。
需要注意的是，为了确保离婚程序的合法性和公正性，夫妻双方均需到场办理离婚手续，或者委托律师或亲友代为办理，同时需要缴纳一定的费用。此外，对于特殊情况下的离婚，比如双方协商一致、一方有过错等情况，还需要提供相关证明材料。总之，南京协议离婚是需要走一定程序的，如果不愿前往民政局办理，可以找专业的律师事务所代为办理，但是需要注意婚姻法规定中离婚申实时效的问题，以免影响自己的权益。
