事实婚姻是指没有正式注册结婚手续的情况下，男女双方以事实居住相互承诺或共同生活一段相对稳定的时间而形成的婚姻关系。这种婚姻形式逐渐成为了一些人的选择，但也存在着异地分居、感情破裂等问题，导致需要协议离婚。
在中国，婚姻法规定了正式注册结婚的具体程序和离婚的法律程序，但对于事实婚姻，目前法律上并没有明确的规定。因此，事实婚姻的协议离婚是否合法需要依据具体的情况来判断。
一般来说，如果男女双方在事实婚姻中形成了稳定的感情并共同生活一段时间，那么他们之间的事实婚姻就拥有了一定的合法性。如果两人之间产生了矛盾或者感情破裂，可以达成协议，签订离婚协议书，并按照约定进行财产分割、子女抚养等问题的处理，那么这种协议离婚是被认为是符合实际情况和当事人的自愿意愿的。
但是，需要注意的是，离婚协议书需要在双方真实、自愿、平等的情况下签订，并需要明确约定分割财产和抚养子女的事项。如果离婚协议书中的条款不符合法律规定，那么就可能会被认为是无效的。
总的来说，事实婚姻可以协议离婚，但需要双方真实、自愿的情况下进行签订，并且需要明确合法的离婚协议书。在处理离婚事宜时，建议当事人还是要寻求法律援助或者律师协助，避免因为各种原因产生后悔或者法律纠纷。
