员工挪用公款是一种违法行为，如何进行判决赔偿是需要权威的法律机构来进行处理的。
首先，需要对员工挪用公款的行为进行调查和确认，并查清楚挪用的金额和时间等相关信息。这些证据必须确凿，以便能够确定员工确实有过挪用公款的行为。
然后，在法律程序中，可以对员工进行惩罚，包括拘留、罚款、刑事处罚等。但是，对于被挪用的公款，应该用民事诉讼的方式，要求员工进行赔偿。
在民事诉讼程序中，应该在法院进行调解工作，以尽量减少诉讼成本和时间，达到让替公司承担损失的员工进行赔偿的目的。如果调解失败，法院会判决员工进行赔偿，并要求员工在一定的时间内进行赔偿，如果员工不履行，可能会面临更严重的惩罚。
最后，如果员工挪用的金额较大，甚至超出了公司的承受能力，公司可以根据需要采取向保险公司申请索赔等方式来进行解决。
总之，员工挪用公款是一个严重的问题，需要进行严格的处理。在处理中应严格遵循法律法规，确保公正、合法，并充分保护被挪用的公共财产权益。
