分居多年后，夫妻双方都可能已经明确了彼此的想法，认为离婚是最好的选择。那么，分居多年的夫妻如何协议离婚呢？
首先，需要明确的是，离婚属于家事纠纷，可以根据《中华人民共和国婚姻法》的规定，通过律师或者人民调解委员会进行协议离婚。如果夫妻之间没有过多的纷争和争议，那么选择人民调解委员会进行协商或许是一个比较好的选择。双方可以协商解决分配财产、抚养子女等问题，制定详细的协议书，经过双方签字确认后生效。
其次，在协议离婚时，夫妻应该做好财产分配的工作。对于分居多年的夫妻，如果没有制定财产协议，那么很可能会存在争议。因此，在离婚前双方应该对夫妻共同财产进行详细的清算，并制定合理的财产分配方案，避免出现争执和矛盾。
最后，协议离婚前还需要考虑到子女的抚养问题。对于离婚夫妻，子女的抚养和教育是一个重要的问题。双方应该充分考虑孩子的身心健康问题，制定出合理的抚养方案。同时，如果需要支付抚养费，应该制定明确的数额，并落实缴纳方式。
总之，分居多年的夫妻协议离婚需要考虑的问题较多，需要充分沟通，制定详细的协议书，并严格遵守。在离婚协议达成后，自觉履行义务，互相尊重，是夫妻分离后正常生活的基础。
