分居多年协议离婚是一种比较普遍而且有效的离婚方式，尤其是对于那些已经分居多年，已经基本上没有夫妻关系，但是双方还没有正式离婚的夫妻来说。这种离婚方式的有效性在于，其基于夫妻之间的协议，只要双方协议离婚的事项都得到合理的安排和妥善的处理，那么这种协议离婚的效力就是可以得到认可的。一般来说，分居多年协议离婚需要经过以下步骤：
首先，需要双方共同确定离婚的事项，如分割财产、抚养子女、赡养老人等。这个过程需要夫妻双方坦诚地交流，尽可能达成一致意见。
其次，协议离婚需要通过书面形式或其他形式，将夫妻之间的协议具体地表述出来，并且在双方都签字确认之后，具有法律上的效力。
最后，需要将协议离婚的文件提交给相关的法律机构进行登记，确认离婚的有效性。
总体来说，分居多年协议离婚在法律上是有效的，但是需要注意一些风险和注意事项。首先，离婚协议的具体内容需要有合理、公正的安排，否则一方可以另行向法院提起离婚诉讼，并要求重新分配财产和支出，这样就有可能导致争议的出现，影响离婚的效力。其次，需要遵守法律程序，如依法办理离婚登记手续等。最后，如果离婚协议中涉及到子女的抚养和赡养老人等重要事项，需要考虑到他们的利益和权益，以保障他们的合法权益。
