在中国，离婚协议是夫妻双方在离婚过程中达成的一种协议，它是为了确保双方在婚姻结束后各自的权益得到保障而制定的。而离婚协议中规定的时间性，比如“三年后自动生效”，必须符合相关法律规定才能生效。
根据我国《婚姻法》，离婚协议应该在双方同意、签名、归档等程序完整之后生效。法律并未规定离婚协议可以设定"三年后自动生效"等条款，因此这种条款是无效的。 如果离婚协议中有设定三年后自动生效条款，当事人想要在规定的时间后生效，必须要重新签订协议并进行公证。
但是需要注意的是，离婚协议中的某些内容，例如财产分割方案、子女抚养权和探望权等，是需要民政部门审核核准的。如果相关条款不符合法律规定或造成一方过于不公，可能会被民政部门拒绝，这时候当事人需要重新协商制定协议。
综上所述，离婚协议中设定“三年后自动生效”是无效的，离婚协议必须在签署并落实完整之后才能生效。当事人在签署离婚协议时必须依法依规，严格遵守相关法律规定，以确保协议生效并保障自己的权益。
