如果夫妻在婚姻关系中未取得房产证，那么在协议离婚时需要注意以下事项：
首先，需要明确夫妻对该房产是否存在共同财产的共识。如果夫妻对该房产的产权归属无异议，那么可以在离婚协议中注明该房产的产权归属问题，明确该房产的所有权归谁所有，并且约定在将来该房产的买卖、出租以及维修等问题上的分配方式。
其次，如果夫妻对该房产的产权归属存在分歧，那么在协议离婚时需要寻求第三方的仲裁或法律援助。可以根据实际情况聘请律师或公证员进行协商或制定协议书，明确产权归属，从而避免因产权分配问题导致的纷争。
第三，需要考虑房屋的使用权以及分时分段使用的问题。双方可以协商在抚养子女期间的使用权，如果子女长大离家后可以出售或分割。
总之，在制定协议离婚时，需要双方共同协商，确保离婚协议的合法性，并且避免将来可能出现的问题。最好寻求律师或公证员的帮助，制定具有法律效力的离婚协议。
