在协议离婚后，处理房屋问题一般会按照以下两种方式：
1. 分割产权：如果夫妻双方是共同购买了房屋，可以通过协商分割产权。分割方式也有很多种，可以将房屋出售，将房屋面积分割，或者一方将自己的产权出售给对方，也可以将产权划分为持股的方式等等。
2. 配偶居住权：如果夫妻中的一方是房屋的所有者，另一方没有产权。离婚后，可以协商给予一方配偶居住权。这种情况下，房屋的所有权和权益仍归原所有者，但是另一方可以在约定的时间内免费居住。
需要注意的是，协议离婚后的房产处理需要在结婚登记处办理离婚手续，并进行公证。此外，为了避免纠纷和不必要的麻烦，建议夫妻双方在离婚前咨询律师，并签订协议，确认房屋处理方式，并经过公证。
