房屋确权协议可以作为离婚案件中的重要证据，但是它是否能够有效地确权需要考虑具体的情况。
首先，房屋确权协议必须是合法有效的。如果协议没有经过法律程序认证或者其中存在违法情况，那么它就不具备法律效力，也就不能作为离婚案件中的证据。
其次，房屋确权协议必须是真实有效的。如果协议是为了掩盖财产转移等不当行为而造假，那么它在离婚案件中的作用也会大打折扣。
最后，离婚案件中的财产分割问题需要综合考虑夫妻的实际情况、共同财产的来源、各自的贡献等因素，在此基础上进行合理的分配。因此，即使有了房屋确权协议，也不能完全依赖它来确定财产分配的比例。
总之，房屋确权协议可以成为离婚案件中的有力证据，但是它是否能够确权需要考虑情况的具体情况，并且需要与相关的法律程序结合起来解决。同时，在处理财产分割问题时，需要全面考虑各种因素，遵循合法合理的原则来进行分配。
