协议离婚后房屋的确权需要遵循以下步骤：
第一步，进行房产调查。离婚夫妻要去房管局核实房屋所有权及抵押情况，甚至需要提供抵押物清单，以确保房屋是否存在争议。
第二步，协商房屋的归属问题。如果双方能够协商，可以签订房屋划分协议书，明确房屋归属及使用权。
第三步，确定房屋的分割方式。如果决定将房屋分割，需要登记不动产权利，并由各自的名下支付相关税费。
第四步，完成房屋所有权变更。双方按照所签订的协议，办理相关手续，完成房屋所有权变更。
最后，在进行离婚后房屋确权的所有过程中，一定要注意保留相关证据，避免因为缺乏证据而造成争议。同时，如果双方无法协商，可以通过法律途径解决争议。
