在离婚协议中，对于共有房屋该如何处理是一个比较复杂的问题。通常来讲，夫妻双方对于共有房屋的共有份额都应该进行明确的划分，并协商确定后再进行处理。
首先，夫妻双方可以协商自愿达成协议，协商确定房产归属，确保双方合理的权益得到保护。这一点可以通过财产评估和财产调查来得出共有房屋的目前价值和房产权属情况，再由双方共同协商决定。
其次，夫妻双方可以协商达成出售共有房屋的协议，把共有房产出售掉，等于按照各自的共有份额，平分房产所获得的收益。
再者，家庭财产状况的情况下，夫妻双方可以通过其他形式来达成协商。例如，由一方回购另一方的共有份额，从而达到私人拥有房屋的效果。
最后，离婚协议中的共有财产分割必须合法合理，协议内容和形式都必须合规并经过公证。
总之，对于共有房屋的分割，夫妻双方需要通过充分协商，以达成合法合理的协议，并由公证机构认证，最终实现公平合法的财产分割。
