协议变更抚养权的程序与常规民事诉讼略有不同，一般可以通过以下两种途径进行：
第一种途径是通过仲裁。如果父母双方在协议变更抚养权方面存在争议，但双方又不想通过法庭来解决，则可以选择进行仲裁。仲裁采取的方式通常是由双方协商好并选定一位中立的仲裁员，让仲裁员进行调解，最终达成一个双方都能接受的协议。仲裁通常比较快速，而且费用也相当低廉，因此比较适合抚养权变更之类的小纠纷。
第二种途径是通过诉讼。如果经过仲裁后仍然无法达成一致，或者双方根本没有兴趣进行仲裁，那么可以考虑通过法庭进行诉讼。诉讼通常需要通过律师代理，同时需要缴纳一定的诉讼费用。在诉讼过程中，双方需要提交各自的证据，并请主持案件的法官进行裁决。诉讼通常比较耗时，但是对于一些具有重要意义的争端，这可能是唯一的解决方式。
总的来说，协议变更抚养权的程序还是比较复杂的，需要根据具体情况选择不同的途径。无论是选择仲裁还是诉讼，都需要花费一定的时间和精力，因此双方在协商阶段就应该尽可能地达成共识，避免不必要的矛盾。
