在农村，宅基地是居民居住和生产的基地，依法享有使用权。在盖房的问题上，根据《农村宅基地使用管理办法》规定，宅基地只能建设一栋住房，且住房建筑面积不得超过90平方米。如果要盖两层，则必须在一层的基础上进行扩建，也就是说，不能独立建造一栋高度为两层的房屋。
此外，根据《城市规划法》相关规定，土地利用达到50%以上，就应该纳入城市规划管理，只能建设符合城市规划的建筑。因此，在农村宅基地上盖两层房屋也存在不合法的问题。
如果在不符合法律法规的情况下建造多层房屋，将面临各种风险。首先，违反了相关法律法规的规定，可能会面临行政处罚或者法律纠纷。其次，盖房的设计和施工存在安全隐患，如果出现事故，责任将十分严重。
总之，为了避免法律风险，农村宅基地的建筑及扩建需符合法律法规，建议先与相关部门咨询，必要时请专业人士进行设计与施工，以确保建筑安全合规。
