当夫妻双方达成协议，启动离婚程序并办理相关手续，法院会对双方的离婚协议进行审核，确认符合法律规定后，正式裁定双方离婚。协议离婚是一种相对简单、快捷的离婚方式，相比起争议离婚，其时间和费用成本均要较低。但是，即便是协议离婚，在涉嫌不良诉讼记录或犯罪记录方面，还是存在相关情况被记录的可能性。
在协议离婚中，如果双方在婚姻关系中发生过违法行为，例如家暴、虚构暴力威胁、伪造证据或物证、隐瞒财产等，这些行为会被记录下来。而且，如果有相关证据证明，法院还可能将这些行为的结果甚至是惩罚措施写进协议中，这些内容同样可以被记录在案底中，当然 ，如果双方没有涉及到违法犯罪记录的话，它确实不会在官方档案中留下任何记录。
另一方面，如果协议离婚的双方财产分割问题引发不和谐局面，其中一方可能提交诉讼请求，要求法院公正的裁定财产分割纠纷，这种情况下，如果因此发生在司法程序中失败的裁决，也会对离婚的双方有一定的影响，因为这样的扎实性较强的案件会被记录在法院相关的案例中。
总的来说，协议离婚在离婚程序中的优势性在于快捷、便利、简单，适合不复杂的离婚申请，一般情况下不会留下案底。但是，如果离婚过程中存在争议，譬如谁拥有财产分割权利等纷争，这些内容会被记录下来，而且被记录在案底会影响双方的信用等级和社会个人形象，因此，为了避免产生历史问题的协议离婚，一定要谨慎决定，在离婚协议中要注重细节和法律程序，以确保离婚过程的彻底性和完整性。
