协议离婚在法院中是可以生效的。协议离婚是指夫妻双方在结束婚姻关系时，通过协商达成一致的离婚协议，并提交到法院进行审理。如果法院认为离婚协议符合法律规定，并且符合双方的真实意愿，就会判决协议离婚生效。
协议离婚是透过双方协商，让夫妻在离婚过程中达成一致的意见，从而减少争执、减轻心理负担。同时，与传统的争议离婚相比，协议离婚的程序较为简便，要求也相对较低，因此在中国很常见。而且，协议离婚不会打乱夫妻的生活，也不会对子女产生过多扰动。
但是，在签署协议离婚时，夫妻必须了解自己的法律权利和义务，并用心考虑子女的抚养问题、财产分配等问题。一旦签署了离婚协议，就不容易撤销，如果发现其中有不公平的条款，再次解决这些问题将会和以前相比变得非常困难。
在法律程序中，协议离婚也需要经过审理。法院对离婚协议的内容进行审核，如果发现其中有不符合法律规定的地方，或者协议双方没有达成共识，就不能生效。因此，在协议离婚的过程中，千万不能忽略协议书的审查环节。这样才能确保协议离婚的合法性和可行性，从而最大程度地保障夫妻的各项权利和利益。
