是的，去法院协议离婚是合法的。
在中国，婚姻是由夫妻双方自愿结合而成的，当夫妻双方认为不再想继续婚姻关系时，可以协商离婚并提交离婚协议书到法院进行审批，如果经过审批，法院会根据协议离婚，并颁发离婚证书。在协议离婚时，夫妻双方自愿同意离婚，法院不能强制夫妻维持婚姻关系。此外，离婚协议书需达成合法协议，包括未成年子女抚养、财产分割等。如果离婚协议书未达成合法协议，则法院不会批准协议离婚申请，并要求夫妻双方进行调解或进行诉讼程序。
值得注意的是，只有去法院协议离婚并经过法院审批才是合法有效的离婚。如果只是单方面约定离婚或未经过法院审批，那么可能会面临一系列法律风险和纠纷，如子女抚养权、财产分配、房产权等。因此，建议夫妻双方在离婚时一定要选择合法渠道，通过法律手段来保护自己的合法权益。
