协议离婚后，公积金可以根据夫妻协商达成的协议来处理。如果夫妻协商一致，可以选择将共同存入的住房公积金进行分割，由双方按照约定的比例分配。如果一方另外购买了房产，可以选择将个人账户中的公积金进行提取，但要注意必须满足提取条件，如购买首套自住房、支付教育、医疗等支出等。
需要注意的是，在离婚协议达成之前，不要随意提取公积金，以免违反法律规定，可能会遭受处罚或面临法律纠纷。此外，在提取公积金时，需要提供相关证明材料，如身份证、婚姻证明、离婚协议等，以便公积金中心审核并确认。
总的来说，协议离婚后公积金的处理方式要根据具体情况和协议内容来确定，对双方都要公平合理，并遵守法律规定，以免给自己带来不必要的麻烦和损失。
