违章加盖拆迁赔偿协议是指在拆迁前未经房屋所有权人同意，拆迁单位单方面将赔偿协议与房屋所有权人签订，并违规盖章。其实质是对房屋所有权人权益的侵犯，同时也违反了相关法规和规定。
根据《中华人民共和国物权法》和《城市房屋拆迁管理条例》等相关法规和规定，房屋所有权人应当在拆迁过程中获得合法的赔偿，并且拆迁单位应当在拆迁前征得房屋所有权人的同意。因此，违章加盖拆迁赔偿协议是违反法律规定的，是不合法的。
如果房屋所有权人发现自己签署了违章加盖的拆迁赔偿协议，应当及时与拆迁单位进行沟通，并要求拆迁单位重新制定合法的赔偿协议，以保障自己的合法权益。
总之，违章加盖拆迁赔偿协议是不合法的，而且对于房屋所有权人来说，会对自己的合法权益造成很大的损失。因此，对于房屋所有权人来说，一定要慎重对待拆迁赔偿协议，并要求拆迁单位在合法的前提下进行协商和签署。
