拆迁协议是一份法律文件，一旦双方签订并经过公证，就具有法律效力。如果拆迁协议涂改，就视为涉嫌违法行为。在处理这种事情时，需要根据具体情况来采取不同的措施。
首先，如果涂改是因为意思表述不清楚、笔误等无意中所致，可以通过双方协商沟通，重新填写协议，经过公证使其重新生效。如果是涉及到重要条款的改动，需要重新起草一份新协议、重新公证。
其次，如果涂改是一方在未经对方同意的情况下擅自修改，那么对于涉及到的违规问题，需要进行相应的追究和处理。比如，被涂改方可以预先向公证处提供原始的拆迁协议，证明协议内容被恶意涂改，并要求公证处对行为人进行处罚。在没有证据证明行为人的恶意涂改时，还可以联系律师，根据程序提起诉讼，追究其涉嫌犯罪的责任。
最后，建议在签署拆迁协议之前，要仔细阅读，理解协议条款，了解自己的权益，不要轻易签署。签署前可以咨询专业律师，以保障自己的合法权益。
