拆迁协议是一种合法的文件，一旦签订，各方都必须遵守。但是在拆迁过程中，涉及到各种利益关系，可能会出现某一方对协议进行涂改的情况。这种情况可以通过以下方式处理。
首先，必须严格保护拆迁协议的完整性，任何涂改、篡改或伪造协议的行为都必须得到严厉惩罚。如果存在涂改行为，需要及时通知相关政府部门和警方，让他们介入调查。
其次，需要追究责任。如果是被拆迁方涂改拆迁协议，可能是为了争取更多的补偿金，需要对其进行法律追究。如果是拆迁方在协议上涂改，那么需要对其违法行为进行追究，并对其进行严厉惩罚。
还有一种情况就是，涂改可能是双方私下协商的结果。在这种情况下，需要重新制定协议，获得官方的认可，否则这种协议将是非法的。在制定协议的过程中，需要保证公平、公正原则，确保包括经济补偿、生活安置等各项利益得到妥善处理。
最后，还需要强化监管。政府部门需要加强对拆迁协议的监管工作，确保所有协议都是合法、公正的。同时，需要建立投诉机制，让各方都有渠道可以表达自己的诉求和需求，促进协议的合理化、规范化。
总之，拆迁协议是一个重要的法律文件，涂改会导致不可预测的后果和社会纷争，因此一定要严肃对待。在处理涂改问题时，必须以法律为准绳，切实保护各方的合法权益。
