军人离婚有协议需要注意以下几点手续：
1.起草离婚协议书。离婚协议书是离婚程序中必不可少的一部分，应当详细列出离婚的具体事项和双方的权利义务，例如财产分配、子女抚养、探望等等。
2.调解协议书。军人离婚需要经过军队所在地的当地基层人民法院进行调解，需要起草调解协议书。
3.提交申请。双方签署离婚协议书和调解协议书后，应当向人民法院提交离婚申请书，并提供身份证明、婚姻证明、子女证明等相关资料。
4.进行调解。人民法院根据双方的离婚协议书和调解协议书进行调解，如双方无异议，则退还双方申请离婚的申请书。如分歧较大，则需要进一步调解。
5.裁决。如果调解无果，人民法院将根据法律规定作出裁决，并将离婚判决书发给双方。
6.领取离婚证。在离婚裁决生效后，双方可携带离婚裁决书前往婚姻登记处领取离婚证。
总之，军人离婚有协议时，需要按照以上所述的手续进行，以确保离婚程序的合法性和顺利性。
