拆迁款退了协议并不会自动作废，取决于拆迁协议上的条款和双方的约定。一般情况下，拆迁协议在双方达成一致并签署之后就生效，如果退款后双方没有另外达成协议或修改协议，那么拆迁协议依然有效。
然而，在某些情况下，退款之后可能会影响协议的有效性。比如，拆迁款是作为拆迁补偿的一部分，退款可能会导致补偿金额不足，从而无法继续进行拆迁。此外，如果退款是因为协议中双方某一方的欺诈或其他不当行为导致的，另一方可能会要求撤销协议。
因此，退款不一定意味着拆迁协议失效，但退款后在双方之间需要重新协商和达成一致，以确保双方的权益得到保护。建议在签署拆迁协议前，双方应该仔细阅读协议内容，并明确退款条款、违约责任等相关内容，以避免出现争议。
