乙肝是一种慢性病毒性肝炎疾病，可以通过母婴传播，因此一旦母亲感染乙肝病毒，在孩子的抚养权问题上可能会遭遇一些不利的情况。但是，母亲感染乙肝是否会影响孩子的抚养权，需要根据具体情况而定。
首先需要明确，乙肝是一种已纳入法定传染病的疾病，根据相关的法律法规，病患者和携带者的权益受到保护。在具体实践中，如果母亲感染了乙肝，但病情比较稳定，可能不会对孩子的抚养权产生大的影响，但如果母亲的病情比较严重，会导致孩子的生活和健康受到威胁，就需要考虑孩子的抚养权问题。
在处理此类问题时，首先需要考虑孩子的健康和生存权益。如果母亲对乙肝病毒携带者的特殊管理措施遵守得比较好，就可以保护孩子的健康安全，这就需要母亲积极参与相关的治疗和管理，并得到医生的认可。此外，如果父亲能够证明自己比母亲更适合照顾孩子，并能够提供更好的生活条件和保障，就有可能获得孩子的抚养权。
最后，需要强调的是，乙肝携带者和病患者在法律上有权保护自己的权益，而孩子的权益也同样受到法律保护。因此，在处理此类问题时，应该根据实际情况全面考虑各方的利益，尽量做到公平、合理。母亲的抚养权并不是因为患乙肝病毒而被剥夺的，需要按照法律程序和标准来处理，确保孩子的权益得到保障。
