医学就业协议离婚多久失效是一个比较复杂的问题，因为具体情况因地区、单位、人员、岗位和条款的不同有所不同。一般来讲，医学就业协议作为一种特殊的劳动合同，一旦签订就必须遵守其中的条款和规定。尽管如此，如果在协议期限内发生了离婚的事件，劳动法规定的个别条款可能会失效。下面是一些可能的具体情况：
1. 协议中有包含爱情因素的条款，被认定为无效或不合法，或违背了社会公共利益或其他法律法规的规定，可能会对协议的整体性产生影响。
2. 协议中明确规定结婚或离婚会对协议的效力产生影响，这个限定条款是合法有效的。 根据劳动法的规定，以结婚或离婚为由解除劳动合同需要双方协商一致或者证明情形属于法定解除原因之一。 如果协议中没有明确规定，可参照劳动法的规定，具体情况需要视乎实际情况作出判断。
因此，医学就业协议离婚多久失效需要具体情况具体分析。建议在签订协议之前，应仔细阅读合同的所有条款，特别注意是否有关于离婚的特别规定，并对可能产生的影响做好充分的预判和准备。此外也可以咨询有关的法律意见，在遇到问题时协调自己的权益。
