如果离婚相关的问题主要包括子女抚养问题、财产分割问题、婚姻财产证明等等。而对于农村房子的协议，也需要严格按照法律规定来处理。
首先，要清楚农村房子的产权归属。如果是夫妻共同所有的财产，那么离婚后应根据财产分割原则对其进行分割。如果是双方各自的财产，则不用考虑分割问题。
其次，离婚协议中应当包含房子的所有权变更问题，即离婚后房子应归谁所有。如果协议中约定该房屋归妻子所有，那么夫妻共同所有的财产中应当把该房屋列入分割财产中，并按照比例进行分割；或者根据双方的约定，给予对方一定的赔偿。
除此之外，还要约定该房子的使用权问题，即离婚后该房子应由谁继续使用。如果是子女住在该房子中，那么可以约定子女的抚养责任和抚养费用。
最后，合法的离婚协议需要包括法律规定的各个方面，任何一方的合法权益都不能受到损伤。如果需要，双方也可以在协议中约定将农村房屋出售返还其前婚姻财产。总之，在协议中应该根据实际情况尽量细致地规定所有相关问题，以避免日后发生不必要的法律纠纷。
