合作单位之间的财务往来不一定是挪用公款，这要根据实际情况具体分析。但是如果双方之间没有明确的合同、管理规定，或者合同中没有约定明确的资金流向和使用方式等，那么就存在挪用公款的风险。
根据《中华人民共和国刑法》的规定，挪用公款是指国家工作人员在职务上蓄意将公共财产或者集体所有的财物挪作他用或者滥用、私分的行为。这样的行为不仅违反了公务员的职业道德，也是一种违法行为。
如果合作单位之间没有签署正式合同，或者合同中没有规定明确的资金流向和使用方式，那么就容易造成资金的不透明和滥用。例如，某政府部门在拨款给某个社会组织时，可能存在没有按照约定使用资金、未按时还款等情况。这种行为不仅会损害公共利益，也会影响政府部门的形象和信誉。
因此，合作单位之间的财务往来必须依据合同和管理规定进行，确保资金流向和使用方式的透明、规范和合法。此外，还应该加强管理和监督，对资金的流向和使用情况进行实时监测，及时发现和处理违规行为，确保公共财产的安全和有效使用。
