离婚协议中使用两套房产进行资产分割是可以有效执行的。根据《中华人民共和国婚姻法》和《中华人民共和国合同法》的规定，离婚协议是夫妻双方在平等协商、自愿达成的一种协议，具有法律效力。因此，如果离婚协议中明确约定了两套房产的归属，就应该按照协议执行。
当然，作为夫妻双方财产的分割对象，房产的归属需要严格审慎地考虑。夫妻离婚时，双方财产大致可分为共同财产和个人财产两种。对于婚前或离婚前个人已经拥有的房产，通常划归为个人财产，不需分割。而婚姻期间所购买的房产则属于共同财产，需要按照离婚协议约定进行分割。
在分割过程中，双方应当充分了解各自在房产分割上的权利和义务，协商达成一致意见。如果协商不成，则可以请律师协助，或者申请诉讼解决。而在签署离婚协议时，建议夫妻双方外加签约见证人，并将协议进行公证，以确保协议执行的有效性和可靠性。
综上可见，离婚协议中使用两套房产进行资产分割是有效的，但在制定协议时需要充分考虑各方利益，确保协议的明确性、可执行性，避免日后出现纠纷。
