二套房协议离婚是否有效主要取决于协议内容和法律规定。在中国，夫妻离婚时房产分割是一个比较复杂的问题，特别是对于拥有二套及以上房产的夫妻来说，往往需要制定一份协议来明确双方各自的权益和义务。
首先，二套房协议离婚是否有效应该满足法律上的要求。根据《婚姻法》的规定，夫妻离婚时，应依法进行财产分割，包括财产的确认、评估、划分、双方各自的权益和义务等方面。因此，协议的内容必须符合法律规定，双方应该在法律规定范围内进行划分，不能脱离法律框架。
其次，二套房协议离婚是否有效也要考虑协议的具体内容。夫妻在制定协议时，要详细地列出二套房产的归属、使用权、变动及权益转换的情况等，而且协议必须遵守法律原则和公平原则。在协议中，也应该考虑到房产转移所需要满足的各项法定条件，比如应该支付的税费等。
最后，二套房协议离婚是否有效还要考虑实际操作的情形。协议签订后，夫妻双方是否能按照协议实施，是否存在违约行为等都会影响协议的有效性。如果另一方不履行协议，拒绝协议的执行，那么遵循法律程序，通过诉讼等方式解决是必要的。
总之，二套房协议离婚是否有效需要满足法律规定，协议的内容和操作都应该符合法律原则和公平原则。此外，夫妻在签订协议时应当仔细考虑各种情况，尽量确保协议能够顺利地实施。
