分居3个月协议离婚是有效的，但具体情况还需根据当地法律法规及双方协议来确定。在中国，婚姻法明确规定夫妻感情破裂，经过协议分居6个月以上或者一方提出离婚并经人民法院调解，另一方表示同意的，可以离婚。
而在其他国家，离婚的法律规定可能各不相同。例如，德国法律规定，在符合规定条件的情况下，夫妻可以自愿达成协议解除婚姻关系，无需等待分居时间。而在美国，每个州的离婚法律略有不同，分居时间也可能不一样。
因此，在考虑分居3个月协议离婚的情况下，夫妻双方需要了解当地法律法规，并在此基础上进行协商和达成共识。此外，还需要注意婚姻财产分配、子女抚养权、赡养义务等相关问题，以确保离婚过程顺利处理。
