农村宅基地司法拍卖是合法的。根据《中华人民共和国拍卖法》和《中华人民共和国土地管理法》，宅基地属于农村土地，在宅基地使用权没收的情况下，宅基地可以通过司法拍卖来变更权属，而且宅基地用于个人住宅和生产生活需要，属于私产，可以依法处置。
拍卖宅基地前需要进行公告，公告期不少于20日，公告应在拍卖前7日以上连续不间断地在报纸上公告。拍卖程序一般包括摇号抽签、出价、成交三个环节，拍卖成交后需要及时办理土地使用权产权变更手续。
但是，在农村宅基地司法拍卖过程中，需要注意保护权利人合法权益，确保拍卖的公平公正。同时，应该注意处理好农民的土地利益与城镇化进程的关系，通过加强土地管理法律法规制度和政策的制定，优化土地资源配置，更好地保护农民的合法权益。
