是的，法院协议离婚会进行备案。备案是指将协议内容记录在离婚协议书上，并提交到相关机构或者单位备案。协议离婚的备案内容需要包括离婚协议书、离婚协议书签署日期、离婚当事人身份证明等。离婚协议书是离婚当事人与法院达成一致意见的书面文件，是双方推进离婚程序的基础。
法院协议离婚备案的目的是为了确保离婚协议书的真实性、合法性和有效性。备案可以证明离婚协议书是真实有效的，双方在法律上自愿地达成和解协议。备案也可以避免双方存在争执时因缺乏证据而导致无法解决纠纷的问题。
同时，进行备案也可以告知相关机构或者单位离婚事实，以保障离婚当事人的合法权益。例如，在双方开展新的经济活动时，需要提供离婚协议书作为证明，通过备案可以方便证明离婚事实，避免不必要的麻烦。
总之，法院协议离婚备案的作用不容小觑。通过备案，可以维护离婚协议书的合法权益，减少未来可能发生的法律纠纷。因此，离婚当事人在达成和解协议后，应及时进行备案，以确保离婚程序的顺利进行。
