离婚协议中涉及到如何分割自建房的问题，通常需要考虑以下几个方面。
首先，需要确认自建房的产权归属。如果自建房属于夫妻共同所有，那么需要在离婚协议中约定如何分割房产。如果自建房只属于一方所有，那么对于另一方要么放弃对该房产的所有权，要么可以在离婚协议中共同约定保留该房产的使用权或售卖权等。
其次，需要确定自建房的估值。这通常需要通过房地产评估公司等专业机构进行估值，以确保公平合理。
最后，需要约定具体的分割方式。这可以考虑根据自建房的估值占夫妻财产总值的比例来分割，也可以约定一方放弃对其他夫妻财产的分割权等，作为获取自建房的权利。
需要注意的是，在离婚协议中约定的自建房分割方式应当充分考虑双方的现实情况和权益，保证公平合理，避免给双方的生活造成不必要的负面影响。如果遇到难以解决的问题，可以寻求法律专业人士的意见，以确保协议的合法有效性。
