农村宅基地有两份的情况，可能是由于历史原因、土地分割、身份变更等多种原因导致的。这种情况下，需要进行合法合规的处理，以免影响土地的使用和权益。
首先，需要查明两份宅基地的性质，是否属于同一块土地的划分、还是不同的土地块分割而来。如果是同一块土地划分而来，需要对土地进行重新规划和划分，并办理相应手续，确保土地的合法性。如果不同土地块分割而来，则需要查看土地证上的详细信息，如面积、坐落位置、权属等，以便明确土地的使用情况和归属方。
其次，需要根据规划和划分的结果，办理相关的土地证书和使用证书。在土地证书上明确标记宅基地的位置及面积，确保使用权属清晰、清楚。
最后，需要在使用宅基地前，进行相关的申请和审核，如建房预审、建设工程验收等程序。确认使用宅基地的具体用途及房屋状况，确保房屋的合法性及安全性。同时，也要确保宅基地使用、房屋建设和财产权益等方面的税务、劳动等规定和条例全面履行和遵守。
总之，对于农村宅基地有两份的情况，需要进行一系列的规划、划分和手续办理工作，同时保证在使用前做好相关申请和审核以及遵守相关法规和规章制度，确保宅基地的合法性、使用安全性及财产权益的保障。
