变更拆迁协议是指在拆迁过程中，因各种原因需要修改或变更原有拆迁协议的一种行为。虽然变更拆迁协议有其必要性和合法性，但是协议的效力和变更的合法性都需要遵循一定的法律规定。
在变更拆迁协议中，诉讼时效是一个重要的法律问题。一般来说，实行一般民事诉讼时效规定，即自民事诉讼法规定的诉讼时效期限届满之日起计算。按照相关规定，诉讼时效期限为两年，但是也有例外情况，比如财产损害赔偿案件的诉讼时效期限为三年。
需要注意的是，在变更拆迁协议的情况下，当事人必须要及时行使自己的权利，例如到法院起诉、要求仲裁等方式维护自己的权益。如果超过了法律规定的诉讼时效期限，当事人就不能再行使自己的权利了，即使他们的权益受到了侵害。
在处理变更拆迁协议的诉讼案件时，除了需要关注诉讼时效的问题，还需要关注其他法律问题，例如协议的内容、协议的签订过程、当事人的诉求等等。只有全面考虑了这些问题，才能够公正地判断案件并为当事人提供合适的法律救济。
