农村宅基地50年合法性备受争议。为了进一步了解这个问题，我们需要首先了解什么是农村宅基地和50年制度的起源和演变。
农村宅基地是指农村居民在农村土地承包经营范围内，享有的居住和生产经营的土地，每户家庭拥有的宅基地面积有限制。根据中国的《宅基地条例》，宅基地经营期限最长为50年，但该制度的起源可以追溯到上世纪50年代，当时国家开始实行土地改革制度，此时实行的是农村集体所有制，在此背景下，宅基地制度被逐渐形成并且得到了国家的法律保障。
随着经济发展和城镇化进程，越来越多的农民进入城市，涌入城市的农民和城市居民一样，需要有居住地，而政府大规模推行的城市化进程不仅对城市建设和供地要求越来越高，也对农村宅基地制度提出了新的需求。于是，以2008年《宅基地管理暂行条例》为标志，宅基地制度由此受到了进一步的规范。
然而，在这个过程中，农村宅基地50年制度的合法性也被广泛地质疑。因为在实践中，很多农民使用宅基地已经超过了50年，而且许多农民并不接受宅基地征收的补偿方案，认为补偿的标准不合理。还有一些地方政府纵容和支持宅基地非法转让和开发，导致宅基地混乱不堪。
同时，存在于宅基地制度本身的弊端也对50年制度的合法性构成了挑战。比如，宅基地管理的司法监管不足，规划的制度不完善，土地的使用、转移和补偿机制不够健全等等。
综上所述，农村宅基地50年制度的合法性是存在问题的。因此，我们需要进一步完善宅基地制度，加强司法机制的监管和地方政府的主动管理，保障农民权益，不断推动宅基地制度的有效实施。
