协议离婚是夫妻双方经过协商达成一致并向法院提交的有关离婚及分割共同财产、子女抚养等事宜的书面协议。在协议离婚中，如何申请补偿孩子的问题是需要考虑的重要问题之一。
首先，补偿孩子的问题需要被写入协议离婚书中。在协议离婚的书面协议中，需注明双方离婚后对孩子的抚养、教育及费用分担等细节，其中包括如何申请补偿孩子等方面的内容。双方需要就孩子抚养所需费用的估算进行充分的商讨并达成一致。
其次，如果双方无法达成一致，可以寻求法律咨询或司法裁决。法院将根据孩子的实际情况判断并做出公正的裁决。如果一个人被判定需要赡养孩子，那么他或她必须支付孩子的费用。
最后，为确保补偿孩子的费用得到妥善解决，可以在协议离婚中制定一些具体措施。例如，可以制定具体的生活与教育费用分担比例，并且将具体金额写入协议离婚书中。如果对方不履行分担孩子费用的协议，可以向法院提出申请，要求对方履行协议所涉及的费用支出。
总之，在协议离婚中如何申请补偿孩子，需要在双方坦诚协商的基础上做出公正的判断，让孩子得到应有的关爱与照顾，从而确保离婚时孩子权益得到有效保护。
