如果公司合伙人挪用公款，首先需要采取的措施是及时发现，并立即进行记录，以及展开内部审计工作。
接下来，需要按照公司的内部规定，以及相关法律法规的要求，采取相应的程序，对挪用公款的合伙人进行惩罚。
具体来说，可以按照以下步骤进行处理：
1.召开会议，听取有关情况汇报
在发现合伙人挪用公款时，应及时召开公司管理层会议，听取涉事人员的汇报，并了解相关情况。
2.开展内部审计
在听取汇报后，应立即展开内部审计工作，核实被挪用的公款金额、方式、时间等具体情况，以及相关证据。
3.确认违规行为
经过内部审计确认存在合伙人挪用公款的情况后，应当认定其为违规行为。
4.启动公司制度惩戒程序
按照公司制度惩戒程序，对合伙人进行问责，严肃处理，并追究他的法律责任。可以采取停职、调离、降职、罚款或解除合作等措施。
5.报告主管部门
同时，应将违规行为上报到公司主管部门，寻求进一步的处理措施，比如法律诉讼等。
在所有的处理过程中，应坚持依法依规原则，明确追究责任人的责任，同时保护公司及其股东的利益。
