在中国的婚姻法中，夫妻离婚需要经过两个阶段，一个是离婚协议，另一个是向法院提出离婚诉讼。离婚协议是指夫妻自行协商离婚的协议书，一般需要包括财产分割、子女抚养等具体内容。而提出离婚诉讼后，法院会根据《中华人民共和国婚姻法》的规定，对财产分割、子女抚养等问题进行审判和判决。
但有时候在离婚协议中，由于一些原因，夫妻对财产分割、子女抚养等问题的约定存在争议或者存在一定的瑕疵。这时候，夫妻可以向法院提出补办离婚协议的申请。
法院能否补办离婚协议，需要分情况。首先，如果离婚协议存在严重的缺陷，或者约定的内容违反法律规定，或者夫妻行为存在欺诈等情形，那么法院是不能补办离婚协议的。在这种情况下，法院会根据《中华人民共和国婚姻法》的规定，对离婚协议进行撤销或者修订，重新做出相应的裁决。
其次，如果离婚协议存在一些不重要的瑕疵，或者存在一些不确定的内容，那么夫妻可以向法院提出补办离婚协议的申请。法院会根据夫妻的请求，重新审查协议内容，并根据双方的协商达成新的离婚协议。
总的来说，夫妻在协商离婚时，应当认真考虑自己的实际情况，并查阅相关法律法规，避免离婚协议中出现重要的缺陷或者违法内容。如果存在这类问题需要补办离婚协议时，建议夫妻向律师寻求专业的法律帮助，以确保自己的合法权益得到保障。
