一般来说，法院不会补办离婚协议。离婚协议是离婚申请双方自愿达成的协议，双方应当自行遵守。如果一方违反协议，另一方可以向法院提起诉讼，要求对方履行协议。这种情况下，法院可以根据事实和法律规定作出相应的判决或裁定。
如果离婚协议存在缺陷，一方或双方不愿继续执行，也可以向法院提起诉讼，要求变更或废止离婚协议。但要注意的是，法院只在特定情况下才会考虑变更或废止离婚协议，例如：
1. 离婚协议存在严重的不公平性，严重损害了某一方的合法权益；
2. 离婚协议与法律规定相抵触，违反了法律的强制性规定；
3. 离婚协议是在一方受到暴力、威胁或欺诈的情况下达成的，存在违法行为；
4. 离婚协议中确定的子女抚养和财产分割等事项，已经发生了不可抗力的情况，需要重新协商。
总之，离婚协议是离婚申请双方自愿达成的协议，法院不会轻易干预。除非协议存在严重问题，否则法院不会补办离婚协议，而是应当让双方自行协商解决。
