怀孕能协议离婚，但离婚需要遵循相关法律程序。
首先，夫妻双方应当协商离婚事宜，包括子女抚养、房产分割、财产分割等，达成离婚协议书。在协议书中，应当清晰说明怀孕的情况，并就子女抚养、财产分割等做出认真的解决方案。
其次，夫妻双方需要前往当地的民政局进行离婚登记。在登记时，需提供离婚协议书，并进行申请审核、公告等程序。
在离婚过程中，如果孩子的出生时间在离婚程序结束前，可以在离婚协议书中对子女的抚养权、赡养费等做出规定。如果离婚程序已经结束，则需根据相关法规再次申请子女抚养权等事项。
需要注意的是，由于怀孕期间孩子的抚养、教育等费用较高，所以在协议离婚过程中，要充分考虑孩子的需求，平等协商，达成公正解决方案。此外，如果离婚协议书存在任何瑕疵或不完善之处，可能会引起不必要的法律问题，因此建议夫妻双方在离婚前咨询专业律师的意见。
