在起诉离婚的过程中，万一有需要补充协议的情况，可以通过在离婚诉讼的过程中向法院提交补充协议来解决。在进行补充协议时，需要注意以下几点：
1.法律依据
离婚的诉讼程序是在民法典、婚姻法等法律的基础上进行的。在补充协议时，需要明确补充协议的内容与何种法律规定相关。如果相关法律内容无法明确，建议寻求律师的帮助。
2.协议形式
补充协议应当采取书面形式。在书写方面，需要注意清晰、准确地表述双方的意愿，并在协议上加盖双方的签章或者公章，以确保协议的认可和执行。
3.提交时间
补充协议可以在诉讼过程中的任何时候提交。但是，请尽量在离婚诉讼的初期提交补充协议，以免拖延诉讼的进程。如果补充协议中的内容涉及到离婚诉讼的重要问题，可能需要将离婚诉讼的进程暂停，等待相关的协议达成并得到法院认可。这样可以有效地避免因为协议不清晰而引起的后续纠纷。
总之，在起诉离婚的过程中补充协议需要注意以上几个方面，以确保补充协议的合法有效。如果协议内容比较复杂，建议咨询专业律师的帮助，以保障自身的权益。
