协议离婚是指夫妻双方经协商、达成一致意见后，签署离婚协议书，解除婚姻关系的一种离婚方式。在离婚协议中，当事人应当约定诸如财产分割、子女抚养权等相关事项。但是，协议离婚中双方约定的抚养权是否有效，需要看具体情况。
首先，如果离婚协议中没有明确约定子女抚养权，双方没有任何争议，则可以认为没有影响到离婚的有效性。这也说明，在离婚时，子女抚养权并不是必须纳入协议中的。但是，如果双方对子女抚养权存在争议，而协议中并没有明确约定，这就会为日后的抚养权纠纷埋下隐患。
其次，如果双方协议离婚中明确约定了子女抚养权，这种协议就是有效的，具有法律效力。但需要注意的是，协议离婚中的子女抚养权约定，需要与法律规定相一致。例如，法律规定子女的抚养权需要以最有利于孩子的利益为出发点，而不是为了方便双方离婚而随意确定。
最后，如果协议离婚中的子女抚养权约定违反法律规定，将会被视为无效。例如，约定由对方或者第三人承担抚养费用，或者约定一方可以单独决定孩子教育、医疗、住房等事项。这样的约定可能会因为违反法律规定而导致抚养权协议无效。
总之，协议离婚中的子女抚养权的有效性与是否明确约定以及约定是否符合法律规定密切相关。双方离婚时必须慎重考虑到子女的利益，合理约定子女抚养权，才能最大程度保障孩子的权益，也避免后续的抚养纠纷。
