根据我国《婚姻法》的规定，夫妻双方可以协议离婚，但协议离婚必须在有关部门出具的离婚协议书上签字，并经过该部门的审核批准。同时，协议离婚还需要在该地的民政局进行登记。
对于异地协议离婚，根据《中华人民共和国民事诉讼法》规定，家庭关系纠纷案件管辖权属于被告住所地或者原告选择起诉地的人民法院。因此，如果夫妻双方分别居住在不同地区，可以在原告或者被告所在地的人民法院申请离婚，进行异地协议离婚。
在新疆地区，夫妻双方也可以进行异地协议离婚。但需要特别注意的是，新疆地区民间有一些“三书两章一刀”等做法，也就是协议离婚时只签字不公证，这种做法存在风险。因此在进行异地协议离婚时，双方应当选择正规的离婚协议书，以及在有关部门进行公证，确保离婚协议的有效性和合法性。
总之，夫妻双方可以进行异地协议离婚，但要按照法律规定进行，否则可能会存在一定的风险和不利后果。在进行离婚协议时，应注意用正规的离婚协议书以及公证，以确保离婚协议的合法性和有效性。
