新疆协议离婚程序一般需要3个月左右的时间。具体来说，协议离婚的程序分为以下几步：
第一步，起草协议。离婚双方需要协商并起草离婚协议，协议中需要包括离婚原因、子女抚养、财产分割等内容。如果一方不同意离婚，另一方需要申请人民法院判决离婚。
第二步，提交离婚申请。离婚双方需携带身份证、户口簿、结婚证、协议书等相关证明材料前往当地婚姻登记处或民政局提交离婚申请。
第三步，等待30天。自提交离婚申请之后，有一个30天的冷静期，这一期间是为了避免离婚双方因冲动而做出错误的决定，期满后方可办理离婚。
第四步，调解。如果在冷静期结束后一方或两方均不同意离婚，婚姻登记处或民政局将进行调解。如果调解失败，则双方可以向人民法院提起诉讼。
第五步，离婚生效。如果离婚双方协议一致，且符合法律规定，婚姻登记处或民政局会发给离婚证书。离婚从发给离婚证书之日起生效。
总之，新疆协议离婚程序较为简单，但需要双方协商达成一致，并符合法律规定，才能顺利办理。
