在协议离婚中，针对经济适用房的处理可以依据双方的意愿和具体情况进行协商和约定，以下是一般的写法和注意事项：
1. 确定产权归属：首先需要确认经济适用房的产权归属，如果只有一方名下，则可以在离婚协议中注明该房产属于该方个人财产；如果是双方都有产权的，则需要约定如何分割或转让该房产。
2. 约定房屋使用权：如果双方都希望继续共同使用该房产，可以在协议中约定共同使用的方式、使用期限、责任分担等内容；如果不打算共同使用，可约定一方放弃使用该房产并赔偿一定金额给另一方。
3. 约定房屋出售方式：如果双方决定出售经济适用房，则需要约定出售方式、时间、分配比例、权利义务等内容。
4. 购房贷款还款：如果双方需要继续还房贷，则需要约定如何承担还款责任，如约定还款比例、还款时间、赔偿标准等内容；如果一方不愿继续还款，则需要约定另一方如何承担贷款还款。
需要注意的是，在处理经济适用房问题时，双方需尽可能充分、真实地展示房产的资料，如房产证、贷款协议、还款凭证等，以确保协议内容合法、有效。另外，当双方就经济适用房问题达成协议后，需要在法律机构进行备案，以确保协议能够得到有效执行。
