可以的。虽然分居和离婚是两个不同的概念，但是分居协议依然是一种法律文书，可以为分居夫妻制定日常生活、财产分割、抚养子女等方面的规定，从而保障双方权益。
在分居协议中，夫妻双方可以约定共同财产的分割方式以及彼此的权利和义务。比如，可以约定房产的归属、车辆的使用权、财产的分割比例、分居期间的抚养子女责任、财务支出等等。这样在分居期间，夫妻可以有一个比较清晰的约定和分配，避免不必要的纷争和冲突。
同时，分居协议还可以约定离婚方案，为夫妻未来离婚时的分财产、抚养子女等问题提前做好安排，避免离婚后可能的冲突和争议。
需要注意的是，分居协议只是夫妻间的协议，不具有法律强制力。即使签署了分居协议，如果以后双方想要离婚，还是需要按照法律程序进行，而非仅仅依据协议中的约定。因此，在签署分居协议时，双方应该充分了解其法律效力和局限性，并且在需要时可以寻求专业法律咨询。
