根据我国《中华人民共和国法官法》和《中华人民共和国宪法》的规定，法院是国家的司法机构，依照法律处理、审理案件并裁决，维护国家法律的权威性和公正性，保障社会的正常治理秩序。因此，农村宅基地纠纷案件也应由法院来处理。具体来说，农村宅基地纠纷案件的处理包括以下几个方面：
首先，农村宅基地纠纷案件的性质属于民事纠纷，这是由于农村宅基地的使用权和处置权是涉及到公民的合法权益，涉及到土地资源的合理利用和保护，因此需要通过司法机构的审判来解决。法院有对纠纷案件进行仲裁、诉讼和调解等方式处理的权力。
其次，农村宅基地纠纷案件的处理在法律程序上与其他民事案件没有区别。当事人可以向人民法院递交诉状，从而进入民事诉讼程序。在程序上，法院会依法开庭审理，听取当事人的陈述和证据，进行事实认定和法律裁判。在处理过程中，法院可以给予调解，出具调解书，或者依法作出当事人可以上诉的判决书。
最后，法院的判决和裁判是法律的最终解释和维护。如果当事人对法院的判决或裁判持有异议，可以通过上诉或者其他法律程序进行申诉和复审。这样保证了法律的权威性和公正性，同时也保障了当事人的合法权益。
综上所述，农村宅基地纠纷案件需要通过法院来进行处理，并且法院拥有对此类案件进行完整的诉讼，判决和仲裁程序的权力，从而保障了法律公正性和权威性，保障了当事人的合法权益。
